惩毖录第1集：1605年，“惩毖录”作者柳成龙带病书写历史，当年的抗倭名将李将军带领战士们浴血奋战以少胜多。柳成龙写完一部份内容已是体力不支，虚弱的身体令柳成龙忍不住轻咳几声。时间回到1589年，宣祖顺利成为新任皇帝，登位之时宣祖准备举行大典，柳成龙对宣祖举行大典的方式颇有微词，一个官员跟柳成龙产生争执，两人当着宣祖的面互不相让，另外一个官员主动提...

第2集：宣祖研制秘密武器

平义的伙伴见平义夸下海口向宣祖做出保证，吃了一惊心急如焚看着平义。在伙伴的注视下平义面色平静没有一丝紧张的神色，看起来像是非常有信心能帮宣祖救回被倭寇绑走的百姓。

郑汝立造反，宣祖派出手下人捉拿郑汝立，郑汝立不久之后被宣祖派出的人杀害，其它跟郑汝立关系好的朋友都被宣祖调查，一些身居要职的官员曾经跟郑汝立计划一起造反，宣祖彻查了许多身居要职的官员。

柳成长得知宣祖为了查办郑汝立惩治其它官员，心中升起不安来到殿外想拜见宣祖，宣祖坐在殿中不想跟柳成龙见面，柳成龙跪在殿外呼喊宣祖的名号，宣祖坐在殿内不肯宣见柳成龙，柳成龙跪在地上不肯离去，一声接一声呼喊宣祖，宣祖坐在殿内已是心乱如麻，柳成龙跪在殿外一声接一声呼喊宣祖。

反贼郑汝之被宣祖处决，许多官员受到达联，郑大人趁着郑汝之被处决之时抓捕许多敌对官员，虽然有一些官员跟郑汝之造反没有关系，但郑大人还是抓了很多无辜官员。

柳成龙不希望看到朝中官员自相残杀，只得来到殿外跪见宣祖，宣祖坐在殿内不想接见柳成龙，柳成龙跪在地上连声呼喊宣祖，宣祖坐在殿内虽然被柳成龙搅得心烦意乱，但就是不肯开门接见柳成龙。

柳成龙跟李山海谈论朝中官员被抓捕的事情，两人心知郑大人是借着抓郑汝同党的借口陷害其它敌对官员，朝中大部份官员皆被郑大人抓走，宣祖对郑大人的行为不问不管，柳成龙与李山海想不明白宣祖的心思。

郑大人抓完所有官员来到宣祖身边复命，宣祖同意郑大人抓捕柳成龙，柳成龙猜到郑大人一定会为难他，所以提前穿上囚服入宫拜见宣祖，宣祖一脸惊讶看着穿着囚服光着脚的柳成龙步入宫殿，天气虽然寒冷柳成龙却没有一丝感觉，宣祖拿柳成龙反而没有办法，柳成龙声称自己也是郑汝之的同党。

关白跟手下人商量如何入侵朝鲜，朝鲜是郑白非常向往的地方，关白计划派人入侵朝鲜，手下人个个跃跃欲试认定朝鲜是鸡蛋国家轻而易举就能打败，关白跟手下人开完会亲自给王子喂食，所有手下一脸恭敬高举双手高呼王子万岁。

宣祖与柳成龙一起研究火雷，倭寇在武器装备上优于朝鲜，宣祖心知必须研究出先进的武器才能打败倭寇，在宣祖的督促下管理武器的官员研究出了火雷，宣祖叮嘱柳成龙不要对外泄露火雷的秘密，如果泄露了火雷秘密倭寇一定有所防范。

一批倭寇被朝鲜军队抓走，千智认出了其中一个倭寇叫沙华桐，沙华桐跟其它倭寇被关入到牢中即将被砍头，千智来到牢房里面找到了沙华桐，沙华桐一脸茫然不记得千智，千智谎称跟沙华桐是童年时代的伙伴，沙华桐一脸茫然依然记不起童年时代认识千智，千智趁着沙华桐发呆的时候拿出匕首想杀死沙华桐，沙华桐吃了一惊已经忘记后退，紧急关头中柳成龙赶了过来阻拦千智杀掉沙华桐，千智一脸悲愤向柳成龙讲述家人被沙华桐杀害的过程，柳成龙提醒千智不要因为私人恩怨引影国事。

当年沙华桐跟其它倭寇杀害了千智的家人，千智悲痛欲绝掩埋家人的尸体，家人全部被沙华桐为首的倭寇们杀害，千智掩埋家人之前悲声呼喊家人。

柳成龙从千智手中夺回匕首，千智含着眼泪依然没有从痛失家人的悲痛中恢复过来。沙华桐则是一副惊魂不定的模样一声不吭。

不久之后，宣祖来到刑场上监督官差处斩沙华桐以及其它几个倭寇，沙华桐跪在木板上惶恐不安，行刑官挥刀砍死了一个倭寇，紧跟着又有一个倭寇死在行刑官的砍刀下，沙华桐已是吓得魂不附体大脑迅速转动思考如何脱身，几个倭寇相继被行刑官斩杀只剩沙华桐一个人，沙华桐瞪着惊恐不安的眼睛不想死在行刑官手中，行刑官举动准备砍死沙华桐，沙华桐高声对宣祖说话声称知道机秘事情，柳成龙认为沙华桐是想拖延时间，脸上升起不悦催促行刑官赶紧下手，眼看行刑官就要砍死沙华桐，沙华桐忽然高声提起火雷武器，火雷武器只有宣祖和柳成龙知道，当初宣祖叮嘱柳成龙保守火雷武器秘密不能向外界泄露，沙华桐离奇的知道宣祖研究的火雷武器，宣祖与柳成龙皆是吃了一惊。