距离第一季结束时发生的系列事件已经过去好几个月，未经证实的报道称合成人的行为越来越古怪，一个简单但引发轰动的决定带来了连锁反应，Hawkins一家不得不面对不堪回首的过去。一边是长期统治地球的智慧生物人类，另一边是这颗星球上新兴的智慧生物合成人，他们都想确定自己在世界上的位置，一场前所未有的激烈冲突 一触即发。第二季将尝试解答一个重要的问题：谁才有权决定生命的真正意义？

真实的人类第二季6集剧情：米娅变回合成人安妮塔 妮斯卡被当局通缉

　　莫罗博士发现库里想要制造有意识的合成人儿童，但她不赞同库里的做法，便质问库里，莫罗博士认为库里的做法不符合人类伦理，库里却认为自己的做法，是在帮助那些正在失去自己孩子的父母们，让他们的孩子以另外一种方式活下去，而且现在库里已经放走了一批合成人儿童，并跟踪了他们。莫罗博士反驳说，不能用科技解决人类的问题，当莫罗博士并准备离开时，库里告诉莫罗博士，他可以将吉妮的意识转移到合成人身上，让莫罗博士的女儿吉妮能够拥有另外一种人生，听到库里的这一说辞，莫罗迟疑了。　　洛拉回到家，发现米娅正在打扫厨房，许久未见米娅的洛拉非常激动，她拥抱了米娅，拥抱后，洛拉发现米娅又变成了那个没有意识的安妮塔，洛拉想知道是什么使米娅变成了这样，于是便打算让玛蒂查看一下米娅的系统到底出了什么问题，但是此时玛蒂已经离开了家，他们并不知道玛蒂去哪儿了。　　奥蒂离开了玛蒂家，因为玛蒂告诉他，现在他已经拥有 了意识，应该有自己的生活，但是奥蒂发现自己找不到生活的目的和意义，于是他来到了教堂，在告解亭里询问神父自己该怎么做，神父并没有发现他是合成人。听了奥蒂的诉说后，神父告诉奥蒂可以遵循自己的内心，继续帮助他人。奥蒂听了神父的建议，离开教堂后，帮助了一位老年人提东西，奥蒂坐进老人的车了，准备开车送老人回家，但是这个老人认为他这样做非常不礼貌，还辱骂了奥蒂，最终，奥蒂沮丧地回到了玛蒂的家。　　凯伦准备用已经死亡的阿曼达的身份活下去，过另外一种生活。这时，彼得打电话给凯伦，告知凯伦他发现了炽天使，并把炽天使带回了家，现在需要凯伦的帮助。凯伦得知此事后马上回了家，她惊讶地发现原来炽天使是合成人儿童。凯伦通过系统连接，发现这个合成人儿童会每隔24小时自动删除之前存储的记忆，并且发现合成人儿童最初的登录地址是在夸利亚，凯伦告诉彼得，夸利亚邀请了人工智能专家莫罗博士来到了英国，于是他们决定去夸利亚会一会莫罗，但是最终什么信息也没有得到。　　霍金斯一家试图让米娅恢复之前的系统，但是所有的方法都失败了，托比看到这种情况后，觉得只有玛蒂才能有办法让米娅恢复过来，于是告诉他的父母洛拉和乔，玛蒂去寻找利奥，现在应该跟利奥在一起。乔听到托比说的话后，非常担心玛蒂，但是电话联系不上玛蒂。　　玛蒂找到了利奥，这时利奥与海丝特准备带着之前拿到的通行证，闯进夸利亚中心，解救被关在这里拥有意识的合成人。利奥与海丝特商量好之后进入了夸利亚，玛蒂在外面等待，但是利奥与海丝特并没有成功，海丝特被夸利亚一扇带电的防盗门电到引发了功能故障。由于之前海丝特是工厂劳工，自身系统有额外的保护机制，所以在玛蒂的帮助下，海丝特又恢复了正常。醒来的海丝特告诉玛蒂，她跟利奥已经发生了性关系，而且她也发现了玛蒂对利奥不合宜的感情，并且警告玛蒂不要试图阻止利奥完成他们的目标。　　马克西与之前他解救的小闪在一辆废弃的列车上落脚，他也一直在寻找米娅。当马克西看到之前他们抓的那个保安死在树林里的新闻时，他便猜到这个保安是海丝特杀的，马克西给利奥打了电话，他准备将这件事告诉利奥，但电话却是海丝特接的，海丝特告诉马克西，利奥其实已经知道这件事了，但因为她们正在完成一件很重要的事，为此可以不惜一切代价，并说这就是人性。听完海丝特的话，马克西非常生气，并决定将合成人获得意识的触发警报系统修改，这样，利奥就不能使用了。　　乔打通了玛蒂的电话，并且告诉她米娅的情况，玛蒂得知后将重载补丁发给了乔，最终安妮塔重新变回了米娅，但艾德给米娅带来的伤害，让米娅内心不再相信人类。在洛拉家，米娅发现了奥蒂，并从奥蒂那得知玛蒂完成了意识代码，这个代码能够让合成人迅速觉醒。此时的米娅已经对人类非常绝望，她认为利奥拯救有意识合成人的做法是正确的，于是她离开了洛拉家，准备与利奥会合。凯伦与合成人儿童绑定并成为这个儿童的主用户，给这个合成人儿童取名为山姆。　　逃走的妮斯卡已经被当局通缉，当局将一条指令上传给所有合成人，只要发现妮斯卡，合成人就会将妮斯卡的位置汇报给当局，妮斯卡一直逃亡，最终来到了阿斯特丽德在英国的住处。　　索菲的心理疾病并没有得到控制反而越来越严重，她模仿合成人的一言一行，洛拉看到这种情况非常生气，但也无能为力，乔建议使用药物治疗。托比听到父母的对话后，便找到了蕾妮，希望蕾妮能够帮助索菲走出来，因为他认为蕾妮的话对索菲会有所作用，但是蕾妮并没有答应他。　　莫罗博士将夸利亚抓获的一群拥有意识的合成人唤醒，并告诉他们利奥是一个极其危险的人，他正在猎杀像他们一样的合成人，如果利奥联系他们中的哪一位，希望他们可以帮助自己找到利奥。一个叫维罗妮卡的合成人答应了莫罗博士，并表示自己可以帮助她。　　米娅找到了利奥，玛蒂看到米娅非常高兴，认为米娅可以劝阻利奥，让他放弃去夸利亚拯救这些拥有意识的合成人，但是米娅表示她会帮助利奥完成这件事，米娅告诉利奥，玛蒂拥有了让合成人迅速觉醒的代码。